Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFIP11Q9UBB9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms