Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRFN1Q9P244 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRFN1Q9P244 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRFN1Q9P244 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRFN1Q9P244 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRFN1Q9P244 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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