Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD3Q9P035 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms