Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SLC39A9Q9NUM3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms