Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1Q9HCU9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms