Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM5Q9C035 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms