Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms