Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms