Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT17Q9BSW7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT17Q9BSW7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms