Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms