Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms