Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms