Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms