Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms