Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms