Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCG3Q8WXD2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms