Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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ZNF248Q8NDW4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF248Q8NDW4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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