Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMCO5AQ8N6Q1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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