Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FUNDC1Q8IVP5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FUNDC1Q8IVP5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms