Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms