Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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