Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms