Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSSK4Q6SA08 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms