Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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