Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms