Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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