Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms