Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms