Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms