Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLFNL1Q499Z3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms