Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KRTAP27-1Q3LI81 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP27-1Q3LI81 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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