Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms