Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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