Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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