Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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