Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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