Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms