Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIX1Q15475 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms