Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRRQ15256 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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