Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.4 ms