Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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