Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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