Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERV3-1Q14264 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms