Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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