Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms