Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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