Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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