Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TRAF2Q12933 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF2Q12933 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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