Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP1B1Q10567 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms