Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RASGEF1BQ0VAM2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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